شناسایی in silico خانواده ژنی PLD و بررسی الگوی بیان آنها در پاسخ به تنش شوری در گیاه Medicago truncatula

فسفولیپاز  D (PLD) و اسید فسفاتیک حاصل از آن نقش مهمی در تنظیم فرآیندهای سلولی از جمله رشد و نمو و پاسخ به تنش دارد. PLDها یک خانواده ژنی مهم را در گیاهان عالی تشکیل می­دهند. که در آرابیدوپسیس، برنج و پنبه شناسایی شده­اند. در این پژوهش 16 ژن PLD در گیاه Medicago truncatula L. شناسایی شد که براساس دمین­­های پروتئینی، روابط فیلوژنی، ساختار ژن و شباهت توالی به 6 گروه α (4 ژن)، β (2 ژن)، γ (2 ژن)، δ (3 ژن)، ε (2 ژن)، ζ (2 ژن) و φ (1 ژن) تقسیم شد. الگوی بیان ژن­های MtPLD4 و MtPLD9 در زیرگروه α و ژن­های MtPLD13 و MtPLD15 در زیر گروه β/ γ تحت تنش شوریNaCl  با غلظت ds/m 23 در گیاهچه­های چهار هفته­ای M. truncatula L. با استفاده از qRT-PCR بررسی شد. بیان MtPLD4 در طی 48 ساعت نسبت به گیاه شاهد به طور معنی­ داری افزایش داشت. الگوی بیان MtPLD9 و MtPLD15 در ساعات اولیه روند افزایشی و سپس نسبت به گیاه شاهد کاهش بیان داشت. بیان MtPLD13 در طی 48 ساعت کاملا روند کاهشی داشته و سرکوب شد. این نتایج نشان داد که زیرگروه α ژن­های MtPLD کاندیدای مهم و با ارزشی جهت آزمون‌های بعدی و مطالعات ژنومیکس کارکردی است.